Entwicklung von Algorithmen zur Auswertung von eindimensionalen Elektrophoresegelen
Development of algorithms for the analysis of one-dimensional electrophoresis gels
- Im Rahmen dieser Arbeit werden die physikalische Grundlage und einige Begriffe der Elektrophorese kurz erläutert, Probleme genannt und Schritte aufgezeigt, die hinsichtlich einer automatisierten Auswertung durchzuführen sind. Dabei kommt eine eigens entwickelte Testumgebung zum Einsatz. Es werden verschiedene Möglichkeiten zur Aufbereitung von Bildern unterschiedlicher Qualität dargestellt, ein Verfahren zur automatischen Erkennung von Lanes ausführlich beschrieben und die Funktionsweise alternativer Möglichkeiten kurz angesprochen. Weitere Themen befassen sich mit unterschiedlichen Möglichkeiten der Hintergrundsubtraktion und Bandendetektion. Die Illustration der Umsetzung und Implementierung der Algorithmen erfolgt im Anschluss an die Beschreibung verschiedener Berechnungsverfahren zur Volumenbestimmung der Banden. Im Zusammenhang mit den entsprechenden Arbeitsschritten werden die Aspekte der direkten oder indirekten Einflussnahme des Anwenders auf die Analyse beschrieben.
Author: | Jens Kummich |
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Advisor: | Benno FellenbergGND, H. Mixtacki |
Document Type: | Diploma Thesis |
Language: | German |
Name: | biostep® GmbH Meinersdorfer Straße 47a, 09387 Jahnsdorf |
Date of Publication (online): | 2007/02/02 |
Year of first Publication: | 2006 |
Date of final exam: | 2006/12/01 |
Tag: | Bande; Hintergrundsubtraktion; Lane |
GND Keyword: | Bildverarbeitung; Elektrophorese; EM-Algorithmus |
Page Number: | 68 Seiten, 69 Abb., 5 Tab., 17 Lit. |
Faculty: | Westsächsische Hochschule Zwickau / Physikalische Technik, Informatik |
Release Date: | 2007/02/02 |