Open Access

Daniel Kökert

• The here presented work is about the development of an atom pair descriptor based virtual screening system. In the beginning the fundamentals are explained which are the base of the following chapters. The chemical data file formats, the term descriptor as well as the enrichment factor and the process of benchmarking is discussed. In the main part the development of the virtual screening system is explained and afterwards the results on the bcr-abl kinase target protein are interpreted. For the development of the virtual screening system the realization of the atom pair descriptor, the different similarity methods and their selection is discussed. Also the clustering and the functio-nality of the virtual screening system are explained. Afterwards the results of the bcr-abl kinase screening are discussed and the functionality of the virtual screening system is evaluated. Finally a conclusion is given where set goals and achieved outcomes are compared and an outlook for possible future projects is presented.
• Gegenstand der hier vorgestellten Arbeit ist die Erläuterung der Entwicklung eines Atompaar-Deskriptor basierten Virtual Screening Systems. Als erstes werden die wis-senschaftlichen Grundlagen dargelegt, welche die Basis für die folgenden Abschnitte bilden. Es wird auf die Besonderheiten chemischer Dateiformate, den Begriff des De-skriptors sowie Enrichment Factors und das Verfahren des Benchmarking eingegan-gen. Im Hauptteil wird der Ablauf der Entwicklung des Virtual Screening Systems erläu-tert und anschließend die Resultate anhand des BCR-ABL Kinase Ziel Proteins inter-pretiert. Bei der Entwicklung des Virtual Screening Systems werden die Realisierung des Atompaar-Deskriptors sowie die verschiedenen Methoden zum Vergleich der Ähn-lichkeiten zwischen verschiedenen Molekülen und deren Auswahl erläutert. Weiterhin wird kurz auf das Clustering Verfahren und die Funktionsweise des Virtual Screening Systems eingegangen. Anschließend werden die Ergebnisse des BCR-ABL Kinase Screenings diskutiert und die Funktionsweise des Virtual Screening Systems bewertet. Abschließend werden in einer Zusammenfassung die gesetzten Ziele sowie deren Verwirklichung verglichen und in einem Ausblick die Möglichkeiten für weiterführende Projekte aufgeführt.